第四季，狂飙一众人飞速前来救场，塞星陷入战火。OP胸前的火种源被击碎，二次毁灭的火种源引发时空隧道，平行空间传送出了一座死寂的黄色星球。
第四季围绕塞星与太空展开激战。很多熟悉面孔都以内战形态出现，比如探长，杯子。
另一方面，红蜘蛛又鬼使神差重新获得了碎片，复活过来，并趁机盗走了部分原生体与火种源碎片逃到地球打算东山再起。塞星的汽车人应接不暇，只得让Sari独自回到地球寻找红蜘蛛，暗中派出并无多少战斗力的星云星人暗中保护。
红蜘蛛和诈骗联手，在一片废旧的军事坟场造出了浑天豹。在那里红蜘蛛碰到了曾操控自己旧身体在寻找改件的马斯特森。阴险的马斯特森靠一张破嘴让红蜘蛛对自己的仇恨转移到了博士身上。马斯特森也靠红蜘蛛的火种碎片制造出了真正的身体，并且将自己改造成了半机械的真正头领战士。Sari父女即将面对一场新的危险.......
关键时刻，一直暗中跟踪红蜘蛛的星云星人黎恩在红蜘蛛军团到达活塞楼之前将Sari转移到了恐龙岛。在恐龙岛，他们发现了毒蜘蛛废弃的实验室。实验室留下的关于半有机机械生命体的资料给了博士以灵感，加上以前马斯特森在萨姆达克公司的研究，博士决定将黎恩改造成为和一般汽车人具有同等战斗能力的战士，但是现有的实验室明显满足不了需要，无法展开身手，只能回活塞楼将博士自己的实验室搬来。机器恐龙并不打算给予Sari帮助，好在隐居的铲土机出手帮忙。守株待兔的红蜘蛛包围了Sari、黎恩和铲土机。又是营救车的出现鬼使神差救了Sari，再次成为英雄。
在建造派的帮助下，恐龙岛逐渐成为了一座暗藏于地下的高科技之城。黎恩经过改造，成为了真正的头领战士，同行的另外几个星云星人也被一一改造。而在另一边，马斯特森巩固了自己的队伍，将几个狐朋狗友也改造成了半有机体的头领战士，甚至他们的身体也不是纯机械的——红蜘蛛并不完全知情，是黑寡妇完成了这一切，她的身边，还有面目狰狞的黄蜂勇士。
在塞星战斗的威震天得知了红蜘蛛偷走了原生体和火种碎片的，雇佣赏金猎人禁闭去地球盗取他认为原本应当属于他的东西。至此，地球上的关系变得复杂而微妙起来：Sari+黎恩一支；中立的机器恐龙；红蜘蛛和浑天豹；与红蜘蛛貌合神离的马斯特森和他的头领军团+暗藏的黑寡妇；赏金猎人禁闭；还有在堕落与正义间思考的铲土机……
视野回到太空，看过塞星核心资料的震荡波知道平行空间传出的黄色大球就是传说中被封住的宇宙大帝。此时霸天虎节节败退，威震天决定在宇宙大帝身上孤注一掷。但是复活的宇宙大帝可是善类？假意和威震天同盟，并给老威以全新的身体（第三季最后一集老威的左臂就已经残破不堪），同时在老威的核心处理器留下了一个自己的后门……
取得巨大优势的汽车人突然间就陷入了恐慌。被修复的老通重新出山。想对抗宇宙大帝，只有启用一个和宇宙大帝同时代的传说之神。而那段历史早就已经被封存起来，连曾经卧底多年的震荡波也没找出答案。通天晓决定向忍者神殿寻求帮助。又经过一番XXOO，找到了塞星的最高级密码，决定激活普神同宇宙大帝展开最后决战。
毒蜘蛛和黄蜂勇士偷偷潜入了塞星，各怀鬼胎，却又如此一致——我要报仇！！机智勇敢的四小强最终战胜了半有机体。如何处置他们？在这战争年代，充满仇恨的汽车人还是决定将他们放逐到太空深处，但正义却仍会夹杂私心的OP仍记着爱丽塔-1，小强们也为黄蜂成为今天这个样子而内疚，虽然他们却没有勇气说出真相。（观众不禁感叹，人性，这就是人性啊！）半有机体被四小强救出，藏了起来。他们自己却被放逐到了宇宙深处。
普莱姆斯和宇宙大帝的战斗最终打响！史上最华丽的正邪之战却没有赢家。巨大的能量造成了时光急速扭曲，战场上的一切突然消失，宇宙恢复静谧。拥有一半有机体的毒蜘蛛和黄蜂在这场时空风暴中被传送到了百万年前的地球。
汽车人和霸天虎从此消失？四小强到底在宇宙的何方？震荡波掌握了多少不为人知的秘密，他能否靠那些塞星的传说将被改造后的威震天（也许该叫惊破天了）救出时空扭曲的战场？我们唯一知道的，他们的战斗仍在地球继续上演。
正印了真人版电影的那句宣传语：我们的地球，他们的战斗……
