请LZ耐心听我瞎推论几点：
1，御天敌在赛博坦内战时期，由于战火连连，生灵涂炭，星球与种族惨遭囹圄。时为汽车人领袖的御天敌不忍自己种族就此泯灭，此时的御天敌已经研制出可以改变种族命运的太空桥装置，由于一心想着拯救种族与母星，秘密研发阶段的御天敌已将帅位让给了自己的得意门徒擎天柱。由于自己亲身经历了战争的残酷，御天敌深感与霸天虎的实力悬殊，如果想要挽救星球、延续种族，就必须做出牺牲。这种牺牲就是要与敌对方达成停火协议，妥协休战，保全余下的汽车人种族，用自己秘密武器重建家园。但是，这个很好的出发点却犯下一个致命的错误——为了一己利益，而不惜牺牲其他星球的生命与资源。御天敌深知这一点会有很多以擎天柱为首的汽车人出来反对（毕竟“自由是每一个智慧生命的权力”这个誓言是自己传授给徒弟的），所以在那个战火纷飞的内战年代，御天敌没有明示自己的想法，不得不暗自秘密地与霸天虎的领袖威震天做了暗地的交易。
2，内战期间的威震天。很多人看了电影3赛博坦来到地球老威望星感叹一幕就认为老威是多么热爱自己的母星。。。其实，这完全是错误的思想。老威要的是暴政的统一，乃至称霸宇宙的野心。而对于赛博坦而言，如果不是老威挑起了内战，致使赛星战火连连，也不至于让赛星如此涂炭，近乎毁灭。而此时的御天敌想要的保存母星、保存种族的提议，对于老威而言并不是坏事。通过御天敌的技术，可以获取其他地外资源，换句话说，只要有资源供其享用，不管挽救的是不是母星，老威一样可以接受。所以二人对此秘密勾当一拍即合！
3，这个秘密的计划，是非常绝密的！御天敌不能让汽车人知道，而老威也不能洋洋自得高调运作此事。所以，这个计划必须越少人知道越好（变3里的红蜘蛛就是在老威炮轰林肯雕像之前才知道此事来由）。老威作为领导绝对有着高于常人的智商，他深知红蜘蛛这样部下的品行，所以对这样的绝密事件只字不提。而选择了自己一大情报心腹——声波，告知了此事。所以，这件事有可能知道的人数就是这三位。而老威更智慧的一点在于，他并没有暗自狂喜立即实施这个计划，而是在等待御天敌的先行动向。也就是说，老威有很多种获得其他能源的方式（例如变2里堕落金刚的方式），老威要做的是看哪种方式最适合自己才会去做。这个绝密计划他甚至瞒过了他的师傅——堕落金刚。
4，御天敌在确定了自己计划后，按照计划开始驾驭方舟号出走。名义上是说为了自己种族命运，去地外获取拯救所需的资源。这使得以擎天柱为首的汽车人都知晓御天敌拥有这种先进技术并外出去实施，但更深层的暗地勾当却全然不知。而霸天虎方面，此时正式战争如火如荼的尾声阶段，霸天虎已经几乎大获全胜了，在没有获悉这项绝密计划的作战部队里，没人会去停止对敌方战舰的攻击。所以，变3开头一幕，霸天虎对方舟的袭击，是真实的！老威不会刻意去通知手下放行御天敌，那样会留下很多破绽，致使整个计划失败。方舟号载着御天敌以及先进的太空桥装备就这样漂泊于天宇之中。。。
5，老威的出走。老威的出走其实和御天敌的出走无关，也就是说不是为了这个绝密而出走的。看过变1前传的都应该知道，老威的出走是因为火种源被已经对战争绝望的汽车人方抛向了宇宙。。。这个唯一让老威垂涎的火种源，类似于自己的命根子一样，他绝不能让这个利器流离失所，所以毅然莽撞地飞离了母星（他都没来得及准备个更快的飞船，只是只身飞向宇宙，实话说这很冒险）寻觅着火种源的下落。
6，不要忽略火种源的能力！火种源的神奇就不多说了。这个东西反正是坠落于咱们的地球了。而它高能的能量场对自己星球上的种族是绝对会有一种无形的吸引力的。老威的时速多快，并没有具体解释过，但你可以通过变2重生后的老威飞离地球直奔赛星这个场景去推测。他一去一回，对地球时间而言，并没有过去很久。所以，老威一直追随着火种源的踪迹一路追了下去。直至他来到地球轨道，获悉了火种源的坐标（这一点也请注意：老威在自身冰封前是已经获悉了火种的坐标的，要不然他不能把坐标留在后来船长的眼镜上），但是老威由于其他原因导航失控，从而坠在了地球的极地，被冰封了起来。但是他在失控之前，完全有时间将火种源的下落信息通知他的心腹声波(你甚至可以理解为声波在得知自己主人飞离母星后，果断尾随出走)。。。但是声波并没有那么快的找到主人与火种源。延误了时日。。。
而另一个不能忽视火种源能力的，就是御天敌与方舟。在漂泊于宇宙的漫长岁月里，方舟的潜意识导航系统还在工作着，他逐步被引向了地球附近。。。但这是个漫长的过程（但在宇宙里，有时候是没有时间感念的，他或许真的没有漂流向地球上看来的这么久，空间时间的不同，导致他到达近地轨道就是近代）于是在近代——登月初始时代的地球时间，方舟号飘了过来，也是由于导航的偏差，它没有坠落于地球，而是撞入了卫星月球的背面。。。
还有一些不能忽视火种源能力的，就是变2里提到的早期来到地球的金刚们，类似天火等。还有后期追来的BBB等汽车人，在这里就不延伸了。
反正上述的金刚都是被火种源所牵引来到了地球，这样使得我们的命运就与这些TF交织在了一起。
7，登月时代。在这个地球这个年代之前，声波已经找到了火种源的下落。但是他并没能找到自己的主人威震天。原因可以理解为老威是处于假死状态，没有发出信号的能力；另外，声波错过了老威被第七区秘密转移的时期。因为声波除了要获悉主人下落以外，更重要的任务还是那项与御天敌的绝密计划的后续工作。这也是因为声波在那个年代，在地球轨道附近感受到了月球的撞击。他第一个进入了方舟，获知了这就是御天敌和他得先进太空桥技术装备。但是他无法唤醒御天敌，也不知道如何使用此项技术。可是他能够做到的就是召唤更多的亲信部下过来（声波应该是老威临行前受命的权威人士之一，有发号施令的权力，参见变2太空卫星形态声波的举动），让霸天虎的亲信秘密前来月球拖走大部分的太空桥装备，藏于地球各地，已被后续之用。另一方面，让武装力量不定时地埋藏于月球背面，伺机行事。而后，登月时代的来临，致使有可能的行动过多败露，声波开始收买地球人为其卖命。。。但是由于不能复活御天敌，所以此事至此暂时搁浅中。。。
可以说，声波在变1-变3里，秘密的做了很多事（参考漫画等），这项绝密的太空桥计划也是如此。最后，他得知了老威的下落（变1时期），但是变1那一战时间仓促，声波没有来得及接应老威。致使老威惨死于山姆之手。。。而后，声波开始为复活老威做着准备，这是其他计划全都靠后。而老威复活后（变2），最先想到的不是御天敌的那项计划，而是想到了更亲的得力助手——自己的师傅——堕落金刚。老威在变1一战知道了如今汽车人与地球军结盟的威力，不得不启用屈膝于堕落金刚来复仇的行动。所以才有了变2的故事，这时候，老威也没有启动和御天敌的秘密计划，这是一种必然的逻辑形式——首先，是自己解冻后的霸气，自己行事（变1），其次，是投靠师傅，强力回来复仇（变2，师傅比叛变的敌人更可靠），变2的行动也未果，这使得老威不得不去唤起沉睡已久的那个绝密计划了。。。
8，在变2一战后，老威受到了重创，在非洲疗养声息的阶段，此时，老威有足够的时间盘算自己下一步的行动。这个喘息的机会，也使得亲信声波能够具体地与老威汇报了御天敌出走直至坠落月球一事的来龙去脉。老威也知道，这是个不得已的下策，毕竟是与敌对方的前领袖合作。但是事已至此，老威才不得不启动了这项计划。由于变2一战，老威得知了化作能源宝的火种源可以复活汽车人，而那个东西又在擎天柱的手里。要想重启月球上得御天敌，就必须谋划出让擎天柱获悉御天敌的下落，从而复活他得计划。
这样，变3的故事就衔接上了。
不知道，推论分析了这么多，对LZ有没有一些帮助。反正我是觉着，如果你相信变真人电影系列是可以梳理的，就一定能把它衔接上。
以上，纯属个人胡诌。
